Версія MySQL 5.1 — це перша версія після того, як в лютому 2008 року SUN придбала за 1 мрлд. дол компанію MySQL AB. Наступна планована версія, MySQL 6.0, зараз перебуває в стадії альфа-тестування. Версія MySQL 5.1 спрямована до підтримки стандарту SQL:2003. Про загальнодоступний (general availability) реліз оголошено 8 грудня 2008 року.

Щодо релізу загальнодоступної версії 5.1, то наразі нема особливого сенсу переходити на нього. Є багато критичних зауважень, зрешту, й
авторитет Майкл Віденіус (Michael Widenius, засновник, головний розробник і CTO MySQL) в своїму блозі критично висловився про реліз — див. Oops, we did it again.

Зокрема він зазначив, що:

• Є 20 відомих критичних баґів у версії 5.1, і ще 35, якщо додати критичні баґи з версії 5.0
• Все ще є більш, ніж 180 серйозних баґів (P2) у 5.1.
• Є більше 300 менш критичних баґів, які ще не скоро будуть виправлені